跳到主要内容

在冠状病毒中发现的神秘'基因内的基因

严重Covid-19感染的危险因素。
(图片信用:Shutterstock)

研究人员在冠状病毒SARS-COV-2的遗传密码中发现了一种神秘的基因 - 几乎隐藏在病毒基因组中的视图,并且直到现在地忽略了很大程度上。

新鉴定的基因 - 叫做 ORF3d  - 是所谓的一个例子 重叠基因:一种有效地隐藏在一串核苷酸中的“基因内的基因”,因为它与其他基因的编码序列重叠。

“就基因组大小而言,SARS-COV-2及其亲属是存在的最长的RNA病毒中,” 解释 Bioinformatician追逐美国自然历史博物馆的纳尔逊。

“因此,他们可能比其他RNA病毒更容易俯瞰'基因组诡计'。”

病毒实际上非常容易托管重叠的基因,因此这并不是令人震惊的发现。无论 ORF3d 真正代表基因组诡计仍有待观察,但无论如何,看起来肯定是棘手的。

重叠基因难以识别遗传序列,因为基因组扫描系统通常会在遗传码串行时会错过它们:编程为拾取单个基因,但不一定在序列中看到相邻基因的核苷酸之间共享的总体指令。

在像SARS-COV-2这样的病毒的背景下,这可能是一个严重的盲点。科学家们已经 赛车尽可能多地理解 自今年年初以来的这种毁灭性病毒,而其遗传化妆的某些方面被阐明(包括 坚定的共识,它不是“在实验室中制造”),仍然是我们尚未知道的。

“缺少重叠基因,让我们忽视了病毒生物学的重要方面,” 尼尔森说.

“重叠基因可以是冠状病毒已经进化以有效复制的方法之一,挫败宿主免疫力,或者将自己传播。”

至于 ORF3d,还有很多关于为什么它在那里,在基因组和跨越其他基因中潜伏。

通过基因组数据库扫描,研究人员发现该基因以前已经鉴定,但仅在冠状病毒的一种变种中影响了植物毒素(在中国广西发现)。

它之前也被错误分类为不相关的基因, ORF3b  - 它存在于其他冠状虫病毒中,包括SARS-COV - 但它们实际上并不相同。

“这两个基因是不相关的并且对完全不同的蛋白质进行编码,”  尼尔森说。 “这意味着关于SARS-COV的知识 ORF3b 不应该适用于SARS-COV-2 ORF3d。“

我们对神秘基因的一件事,基于以前的血液与人类Covid-19患者合作,是 ORF3d 引起强烈的抗体反应。

至于T细胞也将被触发 - 还是其他病毒目的重叠 ORF3d 可能有 - 我们还在黑暗中。它可能相对良性。它可能不是。

“我们尚未知道其功能或如果有临床意义,” 尼尔森说.

“但是,与抗体反应相比,我们预测该基因与T细胞反应相比,该基因相对不太可能检测到T细胞反应。并且可能与基因如何出现的事情有关。”

一件事是肯定的。在只有大约15个已知基因的病毒中,另一个的发现 - 更不用说重叠基因 - 是一个显着的发展。只是有多重要,科学家现在会试图找出答案。

报告了调查结果 el.

本文最初发布 sciencealert.。阅读原文 这里.

暂时没有评论 论坛评论